PRTG زمانی که مشکلات یا مقادیر غیرعادی در شبکه شناسایی کند، به هشدار می‌دهد. این سیستم دارای مجموعه‌ای از روش‌های پیش‌فرض برای ارسال اعلان‌ها است، مانند ایمیل، پوش نوتیفیکیشن، یا درخواست‌های HTTP.
همچنین با استفاده از اپلیکیشن‌های رایگان برای Android و iOS، می‌توان هشدارهای فوری را مستقیماً روی گوشی دریافت کرد.
سیستم هشداردهی را می‌توان متناسب با نیاز تنظیم کرده، هشدارها را زمان‌بندی کرد، یا با استفاده از تنظیمات ارتباطی بین هشدارها از ارسال هشدارهای غیرضروری جلوگیری نمود.
علاوه بر این، با استفاده از PRTG API، امکان طراحی و تنظیم اعلان‌های سفارشی را نیز به کاربر می‌دهد.